2007/Sep/10

กรดอะมิโนมาตรฐาน (standard amino acid) มี 20 ชนิด

โดยมีโครงสร้างดังต่อไปนี้

สามารถจำแนกกรดอะมิโนได้เป็นพวกๆ ตามชนิดของหมู่ R ดังนี้

1) หมู่ R ที่ไม่มีขั้ว และเป็นอะลิฟาติก (nonpolar, aliphatic R groups)

ได้แก่ glycine, alanine, valine, leucine, methionine และ isoleucine

Glycine เป็นกรดอะมิโนที่มีขนาดเล็กที่สุด และมีโครงสร้างง่ายที่สุด (เพราะมีหมู่แทนที่ (R group) เป็นไฮโดรเจนอะตอมเดียว) โดยหมู่แทนที่ของกรดอะมิโนในกลุ่มนี้มีแนวโน้มจะจับกลุ่มกันอยู่ภายในของก้อนโปรตีน ทั้งนี้เป็นเพราะ hydrophobic interaction ส่วนmethionine เป็นกรดอะมิโนที่ไม่ขั้วและมีหมู่แทนที่เป็นหมู่ thioether กรดอะมิโนตัวนี้เป็น 1 ใน 2 ของกรดอะมิโนที่มี sulfur อยู่ในโมเลกุล

Amino acids with nonpolar, aliphatic R groups

2) หมู่ R ที่เป็น อะโรมาติก ( aromatic R groups)

ได้แก่ phenylalanine, tyrosine และ tryptophan

กรดอะมิโนพวกนี้มีหมู่แทนที่ที่เป็นอะโรมาติก จึงมีลักษณะไม่มีขั้วและสามารถทำให้เกิด hydrophobic interaction ได้เช่นกัน หมู่ไฮดรอกซิลของ tyrosine สามารถเกิดพันธะไฮโดรเจนได้ และหมู่ไฮดรอกซิลนี้เป็นหมู่ที่ทำหน้าที่สำคัญในเอนไซม์บางตัวด้วย tyrosine และ tryptophan มีความมีขั้วมากกว่า phenylalanine เพราะ tyrosine มีหมู่ไฮดรอกซิล และ tryptophan มีไนโตรเจนใน indole ring

Amino acids with Aromatic R groups

3) หมู่ R ที่มีขั้ว, แต่ไม่มีประจุ ( polar, uncharged R groups)

ได้แก่ serine, threonine, cysteine, proline, asparagines และ glutamine

หมู่ R ของกรดอะมิโนในกลุ่มนี้เป็น hydrophilic คือ ชอบน้ำ สามารถละลายน้ำได้ดี เพราะ functional group ของกรดอะมิโนในกลุ่มนี้สามารถเกิดพันธะไฮโดรเจนกับน้ำได้ ความมีขั้วของ serine และ threonine เกิดจากหมู่ไฮดรอกซิล ความมีขั้วของ cysteine เกิดจากหมู่ซัลฟไฮดริล ส่วนความมีขั้วของ asparagines และ glutamine เกิดจากหมู่เอไมด์ proline มีโครงสร้างโมเลกุลเป็นรูปวงและมีขั้วเพียงในระดับกลางๆ หมู่อะมิโนของ proline (ที่จริงเป็น imino group) อยู่ในสภาพที่ แข็งเกร็ง(rigid) ยืดหยุ่นไม่ได้มากนัก ทำให้เปปไทด์ส่วนที่มี proline ขาดความยืดหยุ่น (ก์คือเปลี่ยนแปลงรูปร่างของเปปไทด์ในบริเวณนี้มากนักไม่ได้)

Amino acids with polar, uncharged R groups

Cysteine (กรดอะมิโนที่มี sulfur เป็นส่วนประกอบอีกตัวหนึ่ง, นอกเหนือจาก methionine) สามารถถูกออกซิไดส์ได้เป็น dimeric amino acid ที่เชื่อมต่อกันแบบโควาเลนต์ เรียกว่า cystine ซึ่งเป็น cysteine 2 โมเลกุลมาเชื่อมกันด้วย disulfide bond ในโปรตีนหลายๆตัว disulfide bond จะเป็นตัวเชื่อมสายโปรตีน

(ทั้งภายในสายโปรตีนเดียวกันและคนละสายกัน) ให้เชื่อมติดกัน

Cysteine 2 โมเลกุลทำปฏิกิริยาออกซิเดชั่น และเกิดdisulfide bondได้เป็น cystine

4) หมู่ R ที่มีประจุบวก (positively (basic) R groups)

ได้แก่ lysine, arginine และ histidine

หมู่ R ของกรดอะมิโนในกลุ่มนี้จะมีประจุบวกที่ pH 7.0 histidine เป็นกรดอะมิโนเพียงตัวเดียวที่สามารถแตกตัวได้ที่ pH เป็นกลาง (เพราะ pKa ใกล้กับ 7.0) ในการเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์หลายชนิด ใช้ histidine ทำหน้าที่เป็นตัวรับ/ให้โปรตอน (proton donor/acceptor)

Amino acids with positively charged R groups

5) หมู่ R ที่มีประจุลบ (negatively charged (acid) R groups)

ได้แก่ กรดอะมิโนสองชนิด คือ aspartate และ glutamate

กรดอะมิโนในกลุ่มนี้มีหมู่ R ที่มีประจุลบที่ pH 7.0 ทั้งนี้ เพราะมีหมู่คาร์บอกซิลอันที่สองอยู่ในหมู่ R

Amino acids with negatively charged R groups

Comment

Comment:

Tweet


wink double wink tongue
#21 by (49.230.144.110|49.230.144.110) At 2015-07-15 11:26,
wink double wink tongue
#20 by (49.230.144.110|49.230.144.110) At 2015-07-15 11:26,
ขอบคุณมากคะสำหรับความรุbig smile big smile
#19 by (110.169.125.71|110.169.125.71) At 2015-01-29 16:16,
big smile dee mak kub
#18 by Safe (115.67.66.132) At 2013-11-06 09:48,
ควรจะแบ่ง กรดอะมิโนที่จำเป็นและไม่จำเป็น ด้วย,.
#17 by (118.172.130.234) At 2010-08-17 19:42,
ขอบคุณมาก
#16 by ส้ม (124.122.73.115) At 2010-08-14 08:08,
ขอบคุณ
#15 by พร (119.42.120.234) At 2010-08-13 13:51,
ขอบคุณ
#14 by พรยีย (119.42.120.234) At 2010-08-13 13:50,
ขอบคุน คะ

แนน เคมี
#13 by (117.47.151.236) At 2010-08-08 10:39,
สวัสดีค่ะ
#12 by จริยา (118.173.39.190) At 2010-06-19 12:45,
ขอบ คุน มาก ค่ะ

big smile
#11 by AIRin At 2009-11-16 14:58,
ขอบคุณสำหรับข้อมูลมากนะคะ
ถ้าไม่ได้ก็คงแย่ แหละ
ยังไงก็ขอบคุณมากมาก
......อีกที.......
ขอให้พี่โชคดี
และแบ่งปันข้อมูลดีดีแบบนี้
.....ต่อไป.........
#10 by ...น้องมอสี่ (118.174.105.19) At 2009-07-15 20:35,
5555555big smile
#9 by p (118.174.35.209) At 2009-07-15 20:04,
โอ้ววว

นี่หรือคือความรู้

ขอบใจจ้า.....จำเริญๆๆๆ double wink
#8 by (117.47.84.236) At 2009-07-09 10:41,
sad smile
#7 by (117.47.84.236) At 2009-07-09 10:40,
it help me very much thank
#6 by poo (118.174.145.184) At 2009-06-15 18:29,
ดีค่ะ ทำการบ้านส่งอ.พอดีค่ะดีดีดีดีดี
#5 by oiang (124.121.174.205) At 2009-06-06 10:44,
ขอบคุรมาก ๆ เลย ตรงประเด้นกะ
การบ้านเลยค่ะ
#4 by mammaia At 2009-06-01 17:40,
ขอบคุณมากๆๆๆๆๆๆๆๆๆเลยค่ะ
อยากได้โครงสร้างซีสทีนอยู่พอดีค่ะ
ต้องนำไปพร๊เซนต์อาจารย์นะค่ะ
#3 by DEK MAEJO (61.7.173.64) At 2009-01-26 12:49,
#2 by (202.28.248.134) At 2008-10-04 14:39,
ขอบคุณมากๆนะคะ
#1 by Sayako (118.172.49.174) At 2008-06-12 07:28,